Ingenuity anuncia dos nuevas características en el ultimo lanzamiento de IPA

15 Mar, 2011, 10:00 GMT de Ingenuity Systems

REDWOOD CITY, California, March 15, 2011 /PRNewswire/ --

- Ingenuity anuncia el soporte de flujo de trabajo de secuenciación de ARN y la primera capacidad de filtrado microARN de este tipo con el último lanzamiento de IPA

Ingenuity(R) Systems, un proveedor líder de soluciones de información y análisis para investigadores de ciencias de la vida, ha anunciado hoy nuevas características para apoyar los flujos de trabajo de secuenciación de ARN y la investigación de microARN en IPA(R). Los conjuntos de datos de secuenciación de ARN procesados pueden cargarse ya directamente en IPA y analizados en el contexto de rutas y enfermedades para una interpretación biológica rica de los datos. Esto ayuda a los investigadores a centrarse rápidamente y con precisión en la información más importante dentro de sus grandes conjuntos de datos de secuenciación de ARN, agilizando el ritmo de la investigación. IPA también incluye ya un nuevo filtro objetivo microARN, haciendo el IPA la única herramienta disponible comercialmente que permite a los investigadores examinar los pares microARN-mARN previstos y demostrados experimentalmente, priorizando objetivos basados en el contexto biológico relevante, y visualizar las interacciones moleculares de estas relaciones objetivas e impactos biológicos relacionados.

"El nuevo filtro objetivo de microARN más el contenido adicional microARN es una combinación ideal para ayudar a priorizar las interacciones objetivas de miARN", dijo Aaron Sarver Ph.D., University of Minnesota. "Los usuarios de IPA pueden filtrar rápidamente esas interacciones basadas en biología relevante y luego visualizar los efectos biológicos de las interacciones objetivas. IPA hace mucho más sencillo encontrar perspectivas interesantes y me permite utilizar sistemáticamente la documentación de miARN para generar nuevas hipótesis demostrables".

"Si nuestros clientes están trabajando con 'omics o plataformas de secuenciación de próxima generación, hay un vacío fundamental entre la salida de datos y la capacidad de analizar e interpretar los resultados de un modo biológico", dijo Doug Bassett, Ph.D., responsable científico y tecnológico, Ingenuity Systems. "IPA 9.0 estrecha este vacío con soporte para nuevas plataformas, nuevos análisis y nuevo contenido complementario todo ello diseñado para apoyar las necesidades claves de nuestros clientes, como la interpretación biológica de los conjuntos de datos de microARN y NGS. IPA se ha convertido en el estándar industrial para ofrecer perspectivas biológicas potentes de datos a gran escala, y estamos encantados de poder ofrecer nuevas capacidades a los investigadores en estas áreas de investigación rápidamente crecientes. Independientemente de la plataforma, está claro que examinar los genes en el contexto de conocidas relaciones moleculares, procesos biológicos, y relaciones de enfermedad, ofrece una forma más rápida y fiable de identificar perspectivas claves de datos complejos".

El último lanzamiento de IPA incluye importantes mejoras de funciones para ayudar a los investigadores a obtener el máximo valor de los datos generados por NGS, microserie, y experimentos 'omics:

La nueva capacidad de filtro objetivo de microARN primera de su clase y el contenido de microARN: obtenga una perspectiva de los efectos biológicos de los microARN utilizando relaciones microARN-mARN demostradas y previstas.

    
    - Identifique los objetivos de mARN para microARN utilizando relaciones
      de vinculación microARN-mRNA recientemente añadidas de TargetScan,
      además de información sobre relaciones validadas experimentalmente de
      TarBase.
    - Reduzca el número de pasos para identificar fiablemente los objetivos
      examinando los pares microARN-mARN, explorando el contexto biológico
      relacionado de estas relaciones, y filtrando los objetivos de mARN
      basados en las características biológicas relevantes, todo ello dentro
      de una sola herramienta.
    - Priorice fácilmente interacciones objetivas de mARN basadas en niveles
      de confianza de predicciones de interacciones, fuentes, papeles o
      presencia en especies, enfermedades, tejidos, rutas, líneas celulares,
      tipos moleculares y más.
    - Elucide el mecanismo de acción de los microARN.
    - Aproveche los datos de microARN y mARN en combinación con otros tipos
      de conjuntos de datos para un análisis biológico integrado.

Flujo de trabajo de ARN de secuenciación expandido: cargue directamente conjuntos de datos de ARN de secuenciación procesado en IPA para analizar y entender los datos de secuenciación de ARN en el contexto de biología conocida para obtener una completa visión del sistema experimental.

    
    - Pase rápidamente más allá del análisis estadístico de datos de
      secuenciación de ARN de alta potencia para entender las implicaciones
      biológicas de sus datos, de modo que pueda identificar nuevos
      mecanismos de enfermedad, priorizar objetivos de fármacos, generar
      hipótesis y mucho más.
    - Pasar progresivamente de herramientas de procesamiento de datos a la
      interpretación biológica en IPA cargando directamente RefSeq, Ensembl,
      y UCSC IDs.

Interfaz del usuario mejorada: nuevo inicio rápido de IPA y mejoras de usabilidad apoyan una interacción del usuario más intuitiva y acceso racionalizado a una variedad de flujos de trabajo importantes. Los investigadores pueden cargar y analizar sus datos en un solo paso, buscar más rápidamente genes o rutas y visualizar más fácilmente conexiones entre los genes.

Para más información sobre IPA, visite: http://www.ingenuity.com/products/pathways_analysis.html o regístrese para una prueba gratuita en http://www.ingenuity.com/products/IPA/Free-Trial-Software.html

Acerca de Ingenuity(R) Systems

Ingenuity Systems es un proveedor líder de soluciones de información y servicios personalizados para los investigadores de las ciencias de la vida, biólogos computacionales y bioinformáticos y proveedores de la industria de las ciencias de la vida. Si desea más información visite: http://www.ingenuity.com

FUENTE Ingenuity Systems